清雍正六年设盐源县。县南有盐井河，故名。一说因县有盐井，盐源丰盛为名。
　　2000年，盐源县辖8个镇、25个乡：盐井镇、卫城镇、梅雨镇、平川镇、黄草镇、白乌镇、泸沽湖镇、树河镇、双河乡、干海乡、下海乡、棉桠乡、博大乡、桃子乡、前所乡、梅子坪乡、巴折乡、阿萨乡、右所乡、大坡蒙古族乡、长柏乡、洼里乡、沃底乡、金河乡、盖租乡、大河乡、盐塘乡、田湾乡、藤桥乡、大草乡、甘塘乡、马鹿乡、德石乡。　根据第五次人口普查数据：全县总人口313765人，其中各乡镇人口（人）：、盐井镇：35328、卫城镇：19596、梅雨镇：21431、白乌镇：16533、树河镇：9260、黄草镇：13445、平川镇：14124、泸沽湖镇：10633、双河乡：18786、干海乡：15497、下海乡：9182、棉桠乡：13014、甘塘乡：6929、马鹿乡：3224、藤桥乡：3492、田湾乡：3180、德石乡：3667、大河乡：8623、盐塘乡：8471、大草乡：5265、博大乡：6767、金河乡：7831、右所乡：6795、巴折乡：5073、阿萨乡：3878、长柏乡：10513、桃子乡：4911、盖租乡：6008、前所乡：6208、沃底乡：6204、大坡蒙古族乡：3758、洼里乡：3749、梅子坪乡：2390。
　　2004年，盐源县辖8个镇（盐井、平川、卫城、梅雨、黄草、白乌、泸沽湖、树河）、25个乡（双河、干海、下海、棉垭、博大、桃子、前所、巴折、阿萨、右所、长柏、洼里、沃底、金河、盖租、大河、盐塘、田湾、藤桥、大草、甘塘、马鹿、德石、巫木、梅子坪）、1个民族乡（大坡蒙古族）。