1911年四川两个军政府对峙，1912年合并为四川军政府，所辖兵力，史无明载。1913年7月，四川响应孙中山发动的二次革命，成立讨袁军，公推熊克武任总司令，8月兵败。1916年，以蔡锷为总司令的护国军分两路入蜀，第一梯团团长刘云峰；第二梯团团长罗佩金；四川护国军有卢师谛的第四师、熊克武的第五师，余皆不详；为镇压护国军入川的北洋军有曹锟的第三师、张敬尧的第七师、李长泰的第八师，川军有周骏的第一师、刘存厚的第二师。1917年，四川成立靖国军，黄复生任总司令（1918年由熊克武继任），辖刘湘、刘成勋二旅。此后，军阀混战，至1926年驻川军队有国军王赞绪的十六师、孙震的二十师、田颂尧的二十二师、邓锡侯的三十师、刘文辉的三十一师、唐式遵的三十二师、潘文华的三十三师；有川军吕鹿鸣的第一师、李雅材的第二师、王陵基的第三师、罗纬的第四师、何光烈的第五师、冯德斋的第七师、杨启文的第八师、费东明的第九师、鲜英的第十师、罗泽洲的十一师、冷熏南的第十二师、王铭章的十三师、朱家宗的第十四师、杨春芳的第十五师、蓝文彬的第十六师、廖维源的第十七师、龚伯凯的第十八师等等。此外还有若干混成旅。
　　1918年，以四川靖国军总司令名义摄行四川军民两政的熊克武，决定按各军驻防地区，划拨地方税款，由各军自行向各县征收局提用，作为粮饷之需。四川军阀防区制由此形成。因各军驻防日久，不仅在防区内提取粮饷，还干预政事，委任官吏，预征赋税，致使各防区成了军阀割据的“独立王国”。各军阀为了发展自己的势力，扩大防区，争霸四川，不断加紧混战。
　　四川从1912年到1933年，共发生大小军阀混战四百七十多次，其中大多数混战发生在防区制形成之后。1926年下半年，混战中的四川军阀为求自保，纷纷派代表到武汉、长沙，向进行北伐的国民革命军输诚，表示承认国民政府，同意军队易帜改编。于是，蒋介石以国民革命军总司令的名义，先后任命四川军阀杨森、刘湘、赖心辉、刘成勋、刘文辉、邓锡侯、田颂尧为国民革命军的军长，仍统率原部。四川军阀虽已易帜改编为国民革命军，但其军阀本质没有改变，仍然争夺防区，混战不休。
　　军阀防区制延续到1934年。当时由于川陕革命根据地的红四方面军多次粉碎了以刘湘为首的四川军阀的围剿，沉重打击了封建军阀的反动统治，刘湘于11月飞抵南京，向蒋介石求援。1935年春，蒋介石派遣行营“参谋团” 和上官云相等部中央军入川，督导川军围剿红军；还任命刘湘为四川省主席和川康绥靖公署主任，授权他撤销军阀防区。刘湘于是发出一系列通告，限令各军把防区内的军、政、财、文大权交给省政府，并裁军整编，这才结束了防区制度，统一了四川军政，归隶南京政府。
　　四川军阀连年混战，防区割据，关卡林立，捐税苛重，严重阻碍了社会经济文化教育的发展，许多工厂倒闭，商业萧条，农村残破，农产量锐减，文教机关和学校毁损严重。